క్షయ వ్యాధి నిర్ధారణ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ కోసం ఒక కొత్త ఆయుధం: క్షయవ్యాధి హైపర్సెన్సిటివిటీ డయాగ్నసిస్ కోసం మెషిన్ లెర్నింగ్‌తో కలిపి కొత్త తరం టార్గెటెడ్ సీక్వెన్సింగ్ (tNGS)
సాహిత్య నివేదిక: CCa: tNGS మరియు మెషిన్ లెర్నింగ్ ఆధారంగా డయాగ్నస్టిక్ మోడల్, ఇది తక్కువ బ్యాక్టీరియా క్షయ మరియు ట్యూబర్‌క్యులస్ మెనింజైటిస్ ఉన్నవారికి అనుకూలంగా ఉంటుంది.
థీసిస్ టైటిల్: ట్యూబర్‌క్యులస్-టార్గెటెడ్ నెక్స్ట్-జనరేషన్ సీక్వెన్సింగ్ మరియు మెషిన్ లెర్నింగ్: పాసిఫిక్ పల్మనరీ ట్యూబులర్స్ మరియు ట్యూబ్యులర్ మెనింజైటిస్ కోసం అల్ట్రా-సెన్సిటివ్ డయాగ్నొస్టిక్ స్ట్రాటజీ.
ఆవర్తన: 《క్లినికా చిమికా ఆక్టా》
IF: 6.5
ప్రచురణ తేదీ: జనవరి 2024
యూనివర్శిటీ ఆఫ్ చైనీస్ అకాడమీ ఆఫ్ సైన్సెస్ మరియు క్యాపిటల్ మెడికల్ యూనివర్శిటీకి చెందిన బీజింగ్ చెస్ట్ హాస్పిటల్‌తో కలిపి, మాక్రో & మైక్రో-టెస్ట్ కొత్త తరం టార్గెటెడ్ సీక్వెన్సింగ్ (tNGS) టెక్నాలజీ మరియు మెషిన్ లెర్నింగ్ పద్ధతి ఆధారంగా క్షయవ్యాధి నిర్ధారణ నమూనాను ఏర్పాటు చేసింది. కొన్ని బ్యాక్టీరియా మరియు ట్యూబర్‌క్యులస్ మెనింజైటిస్‌తో క్షయవ్యాధిని గుర్తించే సున్నితత్వం, రెండు రకాల క్షయవ్యాధి యొక్క క్లినికల్ డయాగ్నసిస్ కోసం ఒక కొత్త హైపర్సెన్సిటివిటీ డయాగ్నసిస్ పద్ధతిని అందించింది మరియు క్షయవ్యాధి యొక్క ఖచ్చితమైన రోగనిర్ధారణ, డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ మరియు చికిత్సలో సహాయపడింది.అదే సమయంలో, TBM నిర్ధారణలో క్లినికల్ నమూనా కోసం రోగి యొక్క ప్లాస్మా cfDNA తగిన నమూనా రకంగా ఉపయోగించబడుతుందని కనుగొనబడింది.
ఈ అధ్యయనంలో, రెండు క్లినికల్ కోహోర్ట్‌లను స్థాపించడానికి 227 ప్లాస్మా నమూనాలు మరియు సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్ నమూనాలను ఉపయోగించారు, దీనిలో క్షయవ్యాధి నిర్ధారణ యొక్క యంత్ర అభ్యాస నమూనాను స్థాపించడానికి ప్రయోగశాల డయాగ్నొస్టిక్ కోహోర్ట్ నమూనాలను ఉపయోగించారు మరియు స్థాపించబడిన వాటిని ధృవీకరించడానికి క్లినికల్ డయాగ్నొస్టిక్ కోహోర్ట్ నమూనాలను ఉపయోగించారు. డయాగ్నస్టిక్ మోడల్.మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ కోసం ప్రత్యేకంగా రూపొందించిన టార్గెటెడ్ క్యాప్చర్ ప్రోబ్ పూల్ ద్వారా అన్ని నమూనాలను మొదట లక్ష్యంగా చేసుకున్నారు.అప్పుడు, TB-tNGS సీక్వెన్సింగ్ డేటా ఆధారంగా, లేబొరేటరీ డయాగ్నొస్టిక్ క్యూ యొక్క శిక్షణ మరియు ధ్రువీకరణ సెట్‌లపై 5-రెట్లు క్రాస్ ధ్రువీకరణను నిర్వహించడానికి డెసిషన్ ట్రీ మోడల్ ఉపయోగించబడుతుంది మరియు ప్లాస్మా నమూనాలు మరియు సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్ నమూనాల డయాగ్నస్టిక్ థ్రెషోల్డ్‌లు పొందబడతాయి.పొందిన థ్రెషోల్డ్‌ని గుర్తించడం కోసం క్లినికల్ డయాగ్నసిస్ క్యూ యొక్క రెండు టెస్ట్ సెట్‌లలోకి తీసుకురాబడుతుంది మరియు అభ్యాసకుడి రోగనిర్ధారణ పనితీరు ROC కర్వ్ ద్వారా అంచనా వేయబడుతుంది.చివరగా, క్షయవ్యాధి నిర్ధారణ నమూనా పొందబడింది.
పరిశోధన రూపకల్పన యొక్క అంజీర్ 1 స్కీమాటిక్ రేఖాచిత్రం
ఫలితాలు: ఈ అధ్యయనంలో నిర్ణయించబడిన CSF DNA నమూనా (AUC = 0.974) మరియు ప్లాస్మా cfDNA నమూనా (AUC = 0.908) యొక్క నిర్దిష్ట పరిమితుల ప్రకారం, 227 నమూనాలలో, CSF నమూనా యొక్క సున్నితత్వం 97.01%, విశిష్టత 95.65%, మరియు ప్లాస్మా నమూనా యొక్క సున్నితత్వం మరియు విశిష్టత 82.61% మరియు 86.36%.TBM రోగుల నుండి ప్లాస్మా cfDNA మరియు సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్ DNA యొక్క 44 జత నమూనాల విశ్లేషణలో, ఈ అధ్యయనం యొక్క రోగనిర్ధారణ వ్యూహం ప్లాస్మా cfDNA మరియు సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్ DNAలో 90.91% (40/44) అధిక స్థిరత్వాన్ని కలిగి ఉంది మరియు సున్నితత్వం 95.45%. (42/44)ఊపిరితిత్తుల క్షయవ్యాధి ఉన్న పిల్లలలో, ఈ అధ్యయనం యొక్క రోగనిర్ధారణ వ్యూహం అదే రోగుల (28.57% VS 15.38%) గ్యాస్ట్రిక్ జ్యూస్ నమూనాల యొక్క Xpert డిటెక్షన్ ఫలితాల కంటే ప్లాస్మా నమూనాలకు ఎక్కువ సున్నితంగా ఉంటుంది.
అత్తి. 2 జనాభా నమూనాల కోసం క్షయవ్యాధి నిర్ధారణ నమూనా యొక్క విశ్లేషణ పనితీరు
Fig. 3 జత చేసిన నమూనాల నిర్ధారణ ఫలితాలు
తీర్మానం: క్షయవ్యాధికి హైపర్‌సెన్సిటివ్ డయాగ్నస్టిక్ పద్ధతి ఈ అధ్యయనంలో స్థాపించబడింది, ఇది ఒలిగోబాసిల్లరీ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ (నెగటివ్ కల్చర్) ఉన్న క్లినికల్ రోగులకు అత్యధిక గుర్తింపు సున్నితత్వంతో రోగనిర్ధారణ సాధనాన్ని అందిస్తుంది.ప్లాస్మా cfDNA ఆధారంగా హైపర్‌సెన్సిటివ్ క్షయవ్యాధిని గుర్తించడం అనేది క్రియాశీల క్షయవ్యాధి మరియు క్షయ మెనింజైటిస్ నిర్ధారణకు తగిన నమూనా రకం కావచ్చు (మెదడు క్షయవ్యాధి అని అనుమానించబడిన రోగులకు సెరెబ్రోస్పానియల్ ద్రవం కంటే ప్లాస్మా నమూనాలను సేకరించడం సులభం).
అసలు లింక్: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?% 3Dihub ద్వారా
మాక్రో & మైక్రో-టెస్ట్ క్షయవ్యాధి శ్రేణి గుర్తింపు ఉత్పత్తుల సంక్షిప్త పరిచయం
క్షయవ్యాధి రోగుల సంక్లిష్ట నమూనా పరిస్థితి మరియు వివిధ అవసరాల దృష్ట్యా, మాక్రో & మైక్రో-టెస్ట్ కఫం నమూనాల నుండి ద్రవీకరణ వెలికితీత, క్వాల్కమ్ లైబ్రరీ నిర్మాణం మరియు సీక్వెన్సింగ్ మరియు డేటా విశ్లేషణ కోసం పూర్తి NGS పరిష్కారాలను అందిస్తుంది.ఉత్పత్తులు క్షయవ్యాధి రోగుల యొక్క వేగవంతమైన నిర్ధారణ, క్షయవ్యాధి యొక్క ఔషధ నిరోధకతను గుర్తించడం, మైకోబాక్టీరియం క్షయ మరియు NTM టైపింగ్, బ్యాక్టీరియా-ప్రతికూల క్షయ మరియు క్షయవ్యాధి వ్యక్తుల యొక్క హైపర్సెన్సిటివిటీ నిర్ధారణ మొదలైనవి.
క్షయ మరియు మైకోబాక్టీరియా కోసం సీరియల్ డిటెక్షన్ కిట్‌లు:
| వస్తువు సంఖ్య | ఉత్పత్తి నామం | ఉత్పత్తి పరీక్ష కంటెంట్ | నమూనా రకం | వర్తించే మోడల్ |
| HWTS-3012 | నమూనా విడుదల ఏజెంట్ | కఫం నమూనాల ద్రవీకరణ చికిత్సలో ఉపయోగించబడుతుంది, ఇది ఫస్ట్-క్లాస్ రికార్డ్ నంబర్, సుటాంగ్ మెషినరీ ఎక్విప్‌మెంట్ 20230047ను పొందింది. | కఫం | |
| HWTS-NGS-P00021 | హైపర్‌సెన్సిటివ్ క్షయవ్యాధి కోసం క్వాల్‌కామ్ క్వాంటిటీ డిటెక్షన్ కిట్ (ప్రోబ్ క్యాప్చర్ పద్ధతి) | నాన్-ఇన్వాసివ్ (లిక్విడ్ బయాప్సీ) బ్యాక్టీరియా-నెగటివ్ పల్మనరీ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ మరియు బ్రెయిన్ నోడ్యూల్స్‌కు హైపర్సెన్సిటివిటీ డిటెక్షన్;క్షయవ్యాధి లేదా నాన్-ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ మైకోబాక్టీరియా సోకిందని అనుమానించబడిన వ్యక్తుల నమూనాలను హై-డెప్త్ సీక్వెన్సింగ్ మెటాజెనోమిక్స్ ద్వారా విశ్లేషించారు మరియు క్షయవ్యాధి లేదా నాన్-ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ మైకోబాక్టీరియా సోకిందా అనే డిటెక్షన్ సమాచారం మరియు మైకోబాక్టీరియం క్షయవ్యాధి యొక్క ప్రధాన మొదటి-లైన్ డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ సమాచారం అందించబడ్డాయి. | పరిధీయ రక్తం, అల్వియోలార్ లావేజ్ ఫ్లూయిడ్, హైడ్రోథొరాక్స్ మరియు అసిట్స్, ఫోకస్ పంక్చర్ శాంపిల్, సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్. | రెండవ తరం |
| HWTS-NGS-T001 | మైకోబాక్టీరియం టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ కిట్ (మల్టిప్లెక్స్ యాంప్లిఫికేషన్ సీక్వెన్సింగ్ మెథడ్) | MTBC మరియు 187 NTMతో సహా మైకోబాక్టీరియం టైపింగ్ పరీక్ష;మైకోబాక్టీరియం క్షయవ్యాధి యొక్క డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ 13 డ్రగ్స్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ జన్యువుల 16 కోర్ మ్యుటేషన్ సైట్‌లను కవర్ చేస్తుంది. | కఫం, అల్వియోలార్ లావేజ్ ఫ్లూయిడ్, హైడ్రోథొరాక్స్ మరియు అసిట్స్, ఫోకస్ పంక్చర్ శాంపిల్, సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్. | రెండవ/మూడవ తరం డ్యూయల్ ప్లాట్‌ఫారమ్ |
ముఖ్యాంశాలు: HWTS-NGS-T001 మైకోబాక్టీరియం టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ కిట్ (మల్టిప్లెక్స్ యాంప్లిఫికేషన్ మెథడ్)
ఉత్పత్తి పరిచయం
NTM చికిత్స మార్గదర్శకాలలో సాధారణంగా ఉపయోగించే WHO TB చికిత్స మార్గదర్శకాలు, మాక్రోలైడ్‌లు మరియు అమినోగ్లైకోసైడ్‌లలో వివరించిన ప్రధాన మొదటి మరియు రెండవ-వరుస ఔషధాలపై ఉత్పత్తి ఆధారపడింది మరియు ఔషధ నిరోధక సైట్లు ఔషధ నిరోధక సంబంధిత సైట్‌ల యొక్క మొత్తం సమూహాన్ని కవర్ చేస్తాయి. WHO మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ కాంప్లెక్స్ మ్యుటేషన్ కేటలాగ్, అలాగే ఇతర నివేదించబడిన డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ జన్యువులు మరియు మ్యుటేషన్ సైట్లు స్వదేశంలో మరియు విదేశాలలో అత్యధిక స్కోరింగ్ సాహిత్యాల పరిశోధన మరియు గణాంకాల ప్రకారం.
టైపింగ్ గుర్తింపు అనేది చైనీస్ జర్నల్ ఆఫ్ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ అండ్ రెస్పిరేటరీ డిసీజెస్ ప్రచురించిన NTM మార్గదర్శకాలలో సంగ్రహించబడిన NTM జాతులు మరియు నిపుణుల ఏకాభిప్రాయంపై ఆధారపడి ఉంటుంది.రూపొందించబడిన టైపింగ్ ప్రైమర్‌లు 190 కంటే ఎక్కువ NTM జాతులను విస్తరించగలవు, క్రమం చేయగలవు మరియు వ్యాఖ్యానించగలవు.
టార్గెటెడ్ మల్టీప్లెక్స్ PCR యాంప్లిఫికేషన్ టెక్నాలజీ ద్వారా, మైకోబాక్టీరియం యొక్క జన్యురూప జన్యువులు మరియు ఔషధ-నిరోధక జన్యువులు మల్టీప్లెక్స్ PCR ద్వారా విస్తరించబడ్డాయి మరియు గుర్తించాల్సిన లక్ష్య జన్యువుల యాంప్లికాన్ కలయిక పొందబడింది.విస్తరించిన ఉత్పత్తులను రెండవ తరం లేదా మూడవ తరం హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ లైబ్రరీలుగా నిర్మించవచ్చు మరియు లక్ష్య జన్యువుల క్రమ సమాచారాన్ని పొందేందుకు అన్ని రెండవ తరం మరియు మూడవ తరం సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌లు అధిక-లోతు శ్రేణికి లోబడి ఉంటాయి.అంతర్నిర్మిత రిఫరెన్స్ డేటాబేస్‌లో ఉన్న తెలిసిన ఉత్పరివర్తనాలతో పోల్చడం ద్వారా (WHO మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ కాంప్లెక్స్ మ్యుటేషన్ కేటలాగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్‌తో దాని సంబంధంతో సహా), డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ లేదా యాంటీ-ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ డ్రగ్స్‌కు సంబంధించిన ఉత్పరివర్తనలు నిర్ణయించబడ్డాయి.మాక్రో & మైక్రో-టెస్ట్ యొక్క స్వీయ-తెరిచిన కఫం నమూనా చికిత్స పరిష్కారంతో కలిపి, క్లినికల్ కఫం నమూనాల (సాంప్రదాయ పద్ధతుల కంటే పది రెట్లు ఎక్కువ) తక్కువ న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ యాంప్లిఫికేషన్ సామర్థ్యం సమస్య పరిష్కరించబడింది, తద్వారా డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ సీక్వెన్సింగ్ గుర్తింపును గుర్తించవచ్చు. నేరుగా క్లినికల్ కఫం నమూనాలకు వర్తించబడుతుంది.
ఉత్పత్తి గుర్తింపు పరిధి
34ఔషధ నిరోధక-సంబంధిత జన్యువులు18క్షయ నిరోధక మందులు మరియు6NTM మందులు కనుగొనబడ్డాయి, కవర్297ఔషధ నిరోధక సైట్లు;పది రకాల మైకోబాక్టీరియం క్షయ మరియు అంతకంటే ఎక్కువ190NTM రకాలు కనుగొనబడ్డాయి.
టేబుల్ 1: 18+6 డ్రగ్స్ +190+NTM సమాచారం
ఉత్పత్తి ప్రయోజనం
బలమైన క్లినికల్ అనుకూలత: కఫం నమూనాలను సంస్కృతి లేకుండా స్వీయ-ద్రవీకరణ ఏజెంట్‌తో నేరుగా గుర్తించవచ్చు.
ప్రయోగాత్మక ఆపరేషన్ సులభం: మొదటి రౌండ్ యాంప్లిఫికేషన్ ఆపరేషన్ సులభం, మరియు లైబ్రరీ నిర్మాణం 3 గంటల్లో పూర్తవుతుంది, ఇది పని సామర్థ్యాన్ని మెరుగుపరుస్తుంది.
సమగ్ర టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్: MTB మరియు NTM యొక్క టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ సైట్‌లను కవర్ చేయడం, ఇవి క్లినికల్ ఆందోళన, ఖచ్చితమైన టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్, స్వతంత్ర విశ్లేషణ సాఫ్ట్‌వేర్‌కు మద్దతు ఇవ్వడం మరియు ఒకే క్లిక్‌తో విశ్లేషణ నివేదికలను రూపొందించడం.
అనుకూలత: ఉత్పత్తి అనుకూలత, ప్రధాన స్రవంతి ILM మరియు MGI/ONT ప్లాట్‌ఫారమ్‌లకు అనుగుణంగా.
ఉత్పత్తి వివరణ
| ఉత్పత్తి కోడ్ | ఉత్పత్తి నామం | గుర్తింపు వేదిక | లక్షణాలు |
| HWTS-NGS-T001 | మైకోబాక్టీరియం టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ కిట్ (మల్టిప్లెక్స్ యాంప్లిఫికేషన్ మెథడ్) | ONT, ఇల్యూమినా, MGI, సాలస్ ప్రో | 16/96rxn |
పోస్ట్ సమయం: జనవరి-23-2024