క్షయ వ్యాధి నిర్ధారణ మరియు ఔషధ నిరోధక గుర్తింపు కోసం ఒక కొత్త ఆయుధం: క్షయ హైపర్సెన్సిటివిటీ నిర్ధారణ కోసం మెషిన్ లెర్నింగ్‌తో కలిపిన కొత్త తరం లక్ష్య శ్రేణి (tNGS)
సాహిత్య నివేదిక: CCa: tNGS మరియు యంత్ర అభ్యాసం ఆధారంగా ఒక రోగనిర్ధారణ నమూనా, ఇది తక్కువ బాక్టీరియల్ క్షయ మరియు క్షయ మెనింజైటిస్ ఉన్నవారికి అనుకూలంగా ఉంటుంది.
థీసిస్ శీర్షిక: క్షయ-లక్ష్యంగా ఉన్న తదుపరి తరం సీక్వెన్సింగ్ మరియు మెషిన్ లెర్నింగ్: పాసిఫిక్ పల్మనరీ ట్యూబులర్లు మరియు ట్యూబులర్ మెనింజైటిస్ కోసం అల్ట్రా-సెన్సిటివ్ డయాగ్నస్టిక్ స్ట్రాటజీ.
ఆవర్తన: 《క్లినికా చిమికా ఆక్టా》
అయితే: 6.5
ప్రచురణ తేదీ: జనవరి 2024
చైనీస్ అకాడమీ ఆఫ్ సైన్సెస్ విశ్వవిద్యాలయం మరియు క్యాపిటల్ మెడికల్ విశ్వవిద్యాలయం యొక్క బీజింగ్ చెస్ట్ హాస్పిటల్‌తో కలిపి, మాక్రో & మైక్రో-టెస్ట్ కొత్త తరం లక్ష్య శ్రేణి (tNGS) సాంకేతికత మరియు యంత్ర అభ్యాస పద్ధతి ఆధారంగా క్షయ నిర్ధారణ నమూనాను స్థాపించింది, ఇది కొన్ని బ్యాక్టీరియా మరియు క్షయ మెనింజైటిస్‌తో క్షయవ్యాధికి అల్ట్రా-హై డిటెక్షన్ సెన్సిటివిటీని అందించింది, రెండు రకాల క్షయవ్యాధి యొక్క క్లినికల్ డయాగ్నసిస్ కోసం కొత్త హైపర్సెన్సిటివిటీ డయాగ్నసిస్ పద్ధతిని అందించింది మరియు ఖచ్చితమైన రోగ నిర్ధారణ, ఔషధ నిరోధకత గుర్తింపు మరియు క్షయవ్యాధి చికిత్సకు సహాయపడింది. అదే సమయంలో, రోగి యొక్క ప్లాస్మా cfDNA ను TBM నిర్ధారణలో క్లినికల్ శాంప్లింగ్ కోసం తగిన నమూనా రకంగా ఉపయోగించవచ్చని కనుగొనబడింది.
ఈ అధ్యయనంలో, 227 ప్లాస్మా నమూనాలు మరియు సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్ నమూనాలను రెండు క్లినికల్ కోహోర్ట్‌లను స్థాపించడానికి ఉపయోగించారు, దీనిలో ప్రయోగశాల డయాగ్నస్టిక్ కోహోర్ట్ నమూనాలను క్షయ నిర్ధారణ యొక్క యంత్ర అభ్యాస నమూనాను స్థాపించడానికి ఉపయోగించారు మరియు క్లినికల్ డయాగ్నస్టిక్ కోహోర్ట్ నమూనాలను స్థాపించబడిన డయాగ్నస్టిక్ నమూనాను ధృవీకరించడానికి ఉపయోగించారు. అన్ని నమూనాలను మొదట మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ కోసం ప్రత్యేకంగా రూపొందించిన టార్గెటెడ్ క్యాప్చర్ ప్రోబ్ పూల్ ద్వారా లక్ష్యంగా చేసుకున్నారు. తరువాత, TB-tNGS సీక్వెన్సింగ్ డేటా ఆధారంగా, డెసిషన్ ట్రీ మోడల్‌ను ప్రయోగశాల డయాగ్నస్టిక్ క్యూ యొక్క శిక్షణ మరియు ధ్రువీకరణ సెట్‌లపై 5-రెట్లు క్రాస్-వాలిడేషన్ చేయడానికి ఉపయోగిస్తారు మరియు ప్లాస్మా నమూనాలు మరియు సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్ నమూనాల డయాగ్నస్టిక్ థ్రెషోల్డ్‌లను పొందుతారు. పొందిన థ్రెషోల్డ్‌ను గుర్తింపు కోసం క్లినికల్ డయాగ్నసిస్ క్యూ యొక్క రెండు పరీక్ష సెట్‌లలోకి తీసుకువస్తారు మరియు అభ్యాసకుడి రోగనిర్ధారణ పనితీరును ROC వక్రత ద్వారా అంచనా వేస్తారు. చివరగా, క్షయవ్యాధి నిర్ధారణ నమూనా పొందబడింది.
పరిశోధన రూపకల్పన యొక్క చిత్రం 1 స్కీమాటిక్ రేఖాచిత్రం
ఫలితాలు: ఈ అధ్యయనంలో నిర్ణయించిన CSF DNA నమూనా (AUC = 0.974) మరియు ప్లాస్మా cfDNA నమూనా (AUC = 0.908) యొక్క నిర్దిష్ట పరిమితుల ప్రకారం, 227 నమూనాలలో, CSF నమూనా యొక్క సున్నితత్వం 97.01%, విశిష్టత 95.65%, మరియు ప్లాస్మా నమూనా యొక్క సున్నితత్వం మరియు విశిష్టత 82.61% మరియు 86.36%. TBM రోగుల నుండి ప్లాస్మా cfDNA మరియు సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్ DNA యొక్క జత చేసిన 44 నమూనాల విశ్లేషణలో, ఈ అధ్యయనం యొక్క రోగనిర్ధారణ వ్యూహం ప్లాస్మా cfDNA మరియు సెరెబ్రోస్పానియల్ ఫ్లూయిడ్ DNA లలో 90.91% (40/44) అధిక స్థిరత్వాన్ని కలిగి ఉంది మరియు సున్నితత్వం 95.45% (42/44) ఉంది. పల్మనరీ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ ఉన్న పిల్లలలో, ఈ అధ్యయనం యొక్క రోగనిర్ధారణ వ్యూహం అదే రోగుల నుండి గ్యాస్ట్రిక్ జ్యూస్ నమూనాల ఎక్స్‌పర్ట్ గుర్తింపు ఫలితాల కంటే ప్లాస్మా నమూనాలకు ఎక్కువ సున్నితంగా ఉంటుంది (28.57% VS 15.38%).
జనాభా నమూనాల కోసం క్షయవ్యాధి నిర్ధారణ నమూనా యొక్క విశ్లేషణ పనితీరు చిత్రం 2
జత చేసిన నమూనాల 3 విశ్లేషణ ఫలితాలు
ముగింపు: ఈ అధ్యయనంలో క్షయవ్యాధికి హైపర్సెన్సిటివ్ డయాగ్నస్టిక్ పద్ధతి స్థాపించబడింది, ఇది ఒలిగోబాసిల్లరీ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ (నెగటివ్ కల్చర్) ఉన్న క్లినికల్ రోగులకు అత్యధిక గుర్తింపు సున్నితత్వంతో కూడిన రోగనిర్ధారణ సాధనాన్ని అందిస్తుంది. ప్లాస్మా cfDNA ఆధారంగా హైపర్సెన్సిటివ్ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్‌ను గుర్తించడం క్రియాశీల క్షయవ్యాధి మరియు క్షయ మెనింజైటిస్ నిర్ధారణకు తగిన నమూనా రకం కావచ్చు (మెదడు క్షయవ్యాధి ఉన్నట్లు అనుమానించబడిన రోగులకు సెరెబ్రోస్పానియల్ ద్రవం కంటే ప్లాస్మా నమూనాలను సేకరించడం సులభం).
అసలు లింక్: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub
మాక్రో & మైక్రో-టెస్ట్ క్షయవ్యాధి శ్రేణి గుర్తింపు ఉత్పత్తుల సంక్షిప్త పరిచయం
క్షయ రోగుల సంక్లిష్ట నమూనా పరిస్థితి మరియు వివిధ అవసరాల దృష్ట్యా, మాక్రో & మైక్రో-టెస్ట్ కఫం నమూనాల నుండి ద్రవీకరణ వెలికితీత, క్వాల్కమ్ లైబ్రరీ నిర్మాణం మరియు క్రమం మరియు డేటా విశ్లేషణ కోసం NGS పరిష్కారాల పూర్తి సెట్‌ను అందిస్తుంది. ఈ ఉత్పత్తులు క్షయ రోగుల వేగవంతమైన నిర్ధారణ, క్షయవ్యాధి యొక్క ఔషధ నిరోధకత గుర్తింపు, మైకోబాక్టీరియం క్షయవ్యాధి మరియు NTM యొక్క టైపింగ్, బ్యాక్టీరియా-ప్రతికూల క్షయవ్యాధి మరియు క్షయవ్యాధి వ్యక్తుల యొక్క హైపర్సెన్సిటివిటీ నిర్ధారణ మొదలైన వాటిని కవర్ చేస్తాయి.
క్షయ మరియు మైకోబాక్టీరియా కోసం సీరియల్ డిటెక్షన్ కిట్‌లు:
| వస్తువు సంఖ్య | ఉత్పత్తి పేరు | ఉత్పత్తి పరీక్ష కంటెంట్ | నమూనా రకం | వర్తించే మోడల్ |
| HWTS-3012 యొక్క కీవర్డ్లు | నమూనా విడుదల ఏజెంట్ | కఫం నమూనాల ద్రవీకరణ చికిత్సలో ఉపయోగించబడింది, ఇది సుటాంగ్ మెషినరీ ఎక్విప్‌మెంట్ 20230047 అనే ఫస్ట్-క్లాస్ రికార్డ్ నంబర్‌ను పొందింది. | కఫం | |
| HWTS-NGS-P00021 పరిచయం | హైపర్సెన్సిటివ్ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ కోసం క్వాల్కమ్ క్వాంటిటీ డిటెక్షన్ కిట్ (ప్రోబ్ క్యాప్చర్ పద్ధతి) | బ్యాక్టీరియా-నెగటివ్ పల్మనరీ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ మరియు మెదడు నోడ్యూల్స్ కోసం నాన్-ఇన్వాసివ్ (లిక్విడ్ బయాప్సీ) హైపర్సెన్సిటివిటీ డిటెక్షన్; క్షయ లేదా క్షయరహిత మైకోబాక్టీరియా సోకినట్లు అనుమానించబడిన వ్యక్తుల నమూనాలను హై-డెప్త్ సీక్వెన్సింగ్ మెటాజెనోమిక్స్ ద్వారా విశ్లేషించారు మరియు క్షయ లేదా క్షయరహిత మైకోబాక్టీరియా సోకినట్లు గుర్తించే సమాచారం మరియు మైకోబాక్టీరియం క్షయవ్యాధి యొక్క ప్రధాన మొదటి-వరుస ఔషధ నిరోధక సమాచారం అందించబడ్డాయి. | పరిధీయ రక్తం, అల్వియోలార్ లావేజ్ ద్రవం, హైడ్రోథొరాక్స్ మరియు అసిట్స్, ఫోకస్ పంక్చర్ నమూనా, సెరెబ్రోస్పానియల్ ద్రవం. | రెండవ తరం |
| HWTS-NGS-T001 యొక్క కీవర్డ్లు | మైకోబాక్టీరియం టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ కిట్ (మల్టీప్లెక్స్ యాంప్లిఫికేషన్ సీక్వెన్సింగ్ పద్ధతి) | MTBC మరియు 187 NTM తో సహా మైకోబాక్టీరియం టైపింగ్ పరీక్ష；మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ యొక్క ఔషధ నిరోధకతను గుర్తించడం 13 మందులు మరియు ఔషధ నిరోధక జన్యువుల యొక్క 16 ప్రధాన ఉత్పరివర్తన ప్రదేశాలను కవర్ చేస్తుంది. | కఫం, అల్వియోలార్ లావేజ్ ద్రవం, హైడ్రోథొరాక్స్ మరియు అసిట్స్, ఫోకస్ పంక్చర్ నమూనా, సెరెబ్రోస్పానియల్ ద్రవం. | రెండవ/మూడవ తరం ద్వంద్వ వేదిక |
ముఖ్యాంశాలు: HWTS-NGS-T001 మైకోబాక్టీరియం టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ కిట్ (మల్టీప్లెక్స్ యాంప్లిఫికేషన్ పద్ధతి)
ఉత్పత్తి పరిచయం
ఈ ఉత్పత్తి WHO TB చికిత్స మార్గదర్శకాలలో వివరించిన ప్రధాన మొదటి మరియు రెండవ-శ్రేణి ఔషధాలు, NTM చికిత్స మార్గదర్శకాలలో సాధారణంగా ఉపయోగించే మాక్రోలైడ్‌లు మరియు అమినోగ్లైకోసైడ్‌లపై ఆధారపడి ఉంటుంది మరియు ఔషధ నిరోధక సైట్‌లు WHO మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ కాంప్లెక్స్ మ్యుటేషన్ కేటలాగ్‌లోని ఔషధ నిరోధక-సంబంధిత సైట్‌ల యొక్క అన్ని సమూహాలను, అలాగే స్వదేశంలో మరియు విదేశాలలో అధిక స్కోరింగ్ సాహిత్యాల పరిశోధన మరియు గణాంకాల ప్రకారం నివేదించబడిన ఇతర ఔషధ నిరోధక జన్యువులు మరియు మ్యుటేషన్ సైట్‌లను కవర్ చేస్తాయి.
చైనీస్ జర్నల్ ఆఫ్ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ అండ్ రెస్పిరేటరీ డిసీజెస్ ప్రచురించిన NTM మార్గదర్శకాలలో సంగ్రహించబడిన NTM జాతుల ఆధారంగా మరియు నిపుణుల ఏకాభిప్రాయంపై టైపింగ్ గుర్తింపు ఆధారపడి ఉంటుంది. రూపొందించిన టైపింగ్ ప్రైమర్‌లు 190 కంటే ఎక్కువ NTM జాతులను విస్తరించగలవు, క్రమం చేయగలవు మరియు వ్యాఖ్యానించగలవు.
టార్గెటెడ్ మల్టీప్లెక్స్ PCR యాంప్లిఫికేషన్ టెక్నాలజీ ద్వారా, మైకోబాక్టీరియం యొక్క జన్యురూప జన్యువులు మరియు ఔషధ-నిరోధక జన్యువులను మల్టీప్లెక్స్ PCR ద్వారా విస్తరించారు మరియు గుర్తించాల్సిన లక్ష్య జన్యువుల యాంప్లికాన్ కలయికను పొందారు. విస్తరించిన ఉత్పత్తులను రెండవ తరం లేదా మూడవ తరం హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ లైబ్రరీలుగా నిర్మించవచ్చు మరియు అన్ని రెండవ తరం మరియు మూడవ తరం సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫామ్‌లను లక్ష్య జన్యువుల శ్రేణి సమాచారాన్ని పొందడానికి హై-డెప్త్ సీక్వెన్సింగ్‌కు గురి చేయవచ్చు. అంతర్నిర్మిత రిఫరెన్స్ డేటాబేస్‌లో ఉన్న తెలిసిన ఉత్పరివర్తనాలతో పోల్చడం ద్వారా (WHO మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ కాంప్లెక్స్ మ్యుటేషన్ కేటలాగ్ మరియు ఔషధ నిరోధకతతో దాని సంబంధంతో సహా), ఔషధ నిరోధకత లేదా యాంటీ-ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ ఔషధాల ససెప్టబిలిటీకి సంబంధించిన ఉత్పరివర్తనలు నిర్ణయించబడ్డాయి. మాక్రో & మైక్రో-టెస్ట్ యొక్క స్వీయ-తెరిచిన కఫం నమూనా చికిత్స పరిష్కారంతో కలిపి, క్లినికల్ కఫం నమూనాల తక్కువ న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ యాంప్లిఫికేషన్ సామర్థ్యం యొక్క సమస్య (సాంప్రదాయ పద్ధతుల కంటే పది రెట్లు ఎక్కువ) పరిష్కరించబడింది, తద్వారా ఔషధ నిరోధక శ్రేణి గుర్తింపును క్లినికల్ కఫం నమూనాలకు నేరుగా అన్వయించవచ్చు.
ఉత్పత్తి గుర్తింపు పరిధి
34ఔషధ నిరోధకత-సంబంధిత జన్యువులు18క్షయ నిరోధక మందులు మరియు6NTM మందులు కనుగొనబడ్డాయి, వీటిని కవర్ చేస్తూ297 తెలుగుఔషధ నిరోధక ప్రదేశాలు; పది రకాల మైకోబాక్టీరియం క్షయ మరియు అంతకంటే ఎక్కువ190 తెలుగుNTM రకాలు కనుగొనబడ్డాయి.
పట్టిక 1: 18+6 ఔషధాలు +190+NTM సమాచారం
ఉత్పత్తి ప్రయోజనం
బలమైన క్లినికల్ అనుకూలత: కఫం నమూనాలను సంస్కృతి లేకుండా స్వీయ-ద్రవీకరణ ఏజెంట్‌తో నేరుగా గుర్తించవచ్చు.
ప్రయోగాత్మక ఆపరేషన్ సులభం: మొదటి రౌండ్ యాంప్లిఫికేషన్ ఆపరేషన్ సులభం, మరియు లైబ్రరీ నిర్మాణం 3 గంటల్లో పూర్తవుతుంది, ఇది పని సామర్థ్యాన్ని మెరుగుపరుస్తుంది.
సమగ్ర టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్: MTB మరియు NTM యొక్క టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ సైట్‌లను కవర్ చేస్తుంది, ఇవి క్లినికల్ ఆందోళన, ఖచ్చితమైన టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్, స్వతంత్ర విశ్లేషణ సాఫ్ట్‌వేర్‌కు మద్దతు ఇవ్వడం మరియు ఒకే క్లిక్‌తో విశ్లేషణ నివేదికలను రూపొందించడం వంటి కీలక అంశాలు.
అనుకూలత: ఉత్పత్తి అనుకూలత, ప్రధాన స్రవంతి ILM మరియు MGI/ONT ప్లాట్‌ఫామ్‌లకు అనుగుణంగా మారడం.
ఉత్పత్తి వివరణ
| ఉత్పత్తి కోడ్ | ఉత్పత్తి పేరు | డిటెక్షన్ ప్లాట్‌ఫామ్ | వివరణలు |
| HWTS-NGS-T001 యొక్క కీవర్డ్లు | మైకోబాక్టీరియం టైపింగ్ మరియు డ్రగ్ రెసిస్టెన్స్ డిటెక్షన్ కిట్ (మల్టీప్లెక్స్ యాంప్లిఫికేషన్ పద్ధతి) | ONT, ఇల్యూమినా, MGI, సాలస్ ప్రో | 16/96 ఆర్ఎక్స్ఎన్ |
పోస్ట్ సమయం: జనవరి-23-2024