సాహిత్య విశ్లేషణ: పశ్చిమ ఆఫ్రికాలోని అడవి చిన్న క్షీరదాల వైరోమ్ ప్రొఫైలింగ్ కొత్త వైరస్‌లు మరియు జూనోటిక్ ప్రమాదాలను వెల్లడిస్తుంది

ఇటీవల ప్రచురించబడిన ఒక అధ్యయనంమైక్రోబయోమ్పశ్చిమ ఆఫ్రికాలోని సియెర్రా లియోన్‌లో సేకరించిన గబ్బిలాలు, ఎలుకలు, మరియు ష్రూలతో సహా 846 అడవి చిన్న క్షీరదాలపై వైరల్ మెటాజెనోమిక్ విశ్లేషణ నిర్వహించబడింది. ఈ అధ్యయనంలో మొత్తం 39 క్షీరద-సంబంధిత RNA వైరస్‌లను గుర్తించారు, వీటిలో 26 కొత్తవి మరియు 13 గతంలో తెలిసిన వైరస్‌లు ఉన్నాయి. వీటిలో, పారామిక్సోవిరిడే కుటుంబం అత్యధిక వైవిధ్యాన్ని ప్రదర్శించగా, ఎలుకలు అత్యధిక సంఖ్యలో వైరల్ జాతులను (n = 26) కలిగి ఉన్నాయి.

జంతువుల నుండి మానవులకు సంక్రమించే వ్యాధుల ప్రమాద అంచనాలో, ఎన్సెఫలోమయోకార్డిటిస్ వైరస్, లాసా వైరస్, మరియు రోకాహెపెవైరస్ sp. అనే మూడు తెలిసిన జూనోటిక్ వైరస్‌లతో పాటు, వ్యాప్తి చెందే ప్రమాదం ఉన్న మెలియన్ వైరస్, రోడెంట్ హెపటైటిస్ వైరస్, మరియు హన్నివైరస్ A అనే ​​మరో మూడు వైరస్‌లు కూడా బయటపడ్డాయి. ముఖ్యంగా, కొత్తగా గుర్తించిన వైరస్‌లలో, బాట్ లెడంటేవైరస్ 2, మానవులకు సోకే లె డాంటెక్ వైరస్‌తో అత్యంత దగ్గరి జన్యు సంబంధాన్ని చూపించింది. సీరలాజికల్ విశ్లేషణలో, స్థానిక నివాసితులలో 2.8% మందిలో ఈ వైరస్‌కు వ్యతిరేకంగా తటస్థీకరణ యాంటీబాడీలు ఉన్నట్లు గుర్తించారు. ఇది, గతంలో బహుశా గుర్తించబడని మానవ సంక్రమణను సూచిస్తుంది.

ఈ పరిశోధన ఫలితాలు పశ్చిమ ఆఫ్రికాలో ఎలుకల ఆధిపత్యంలో గణనీయమైన వైరల్ రిజర్వాయర్ ఉన్నట్లు స్పష్టం చేస్తున్నాయి మరియు మానవ-జంతు సంబంధిత విషయంలో సమీకృత నిఘా వ్యూహాల యొక్క కీలక ప్రాముఖ్యతను నొక్కి చెబుతున్నాయి. మెటాజెనోమిక్ స్క్రీనింగ్‌ను సెరలాజికల్ ధ్రువీకరణతో కలపడం ద్వారా, జూనోటిక్ మరియు స్పిల్‌ఓవర్ సామర్థ్యం ఉన్న వైరస్‌లను గుర్తించడానికి ఒక పటిష్టమైన చట్రం లభిస్తుంది.

గత దశాబ్దంలో, మానవులలో కొత్తగా పుట్టుకొస్తున్న అంటువ్యాధులలో 60% కంటే ఎక్కువ జంతువుల నుండే ఉద్భవించాయి. గబ్బిలాలు, ఎలుకలు మరియు ష్రూలు జూనోటిక్ వైరస్‌లకు కీలక ఆతిథేయ జీవులుగా గుర్తించబడ్డాయి. జూనోటిక్ వ్యాధులకు ఆఫ్రికా ఒక హాట్‌స్పాట్‌గా విస్తృతంగా పరిగణించబడుతుంది. ఉదాహరణకు, 2014–2016 ఎబోలా వ్యాప్తి సమయంలో సియెర్రా లియోన్ 28,000 కంటే ఎక్కువ కేసులను నివేదించింది.

ఈ ప్రాంతంలో జంతువుల నుండి మనుషులకు సంక్రమించే వ్యాధుల భారం గణనీయంగా ఉన్నప్పటికీ, అడవి చిన్న క్షీరదాలలో వైరస్‌ల వైవిధ్యం మరియు విస్తరణ గురించి తగినంతగా అధ్యయనం జరగలేదు. ఈ లోపాన్ని పూరించడానికి, పరిశోధకులు 2018 మరియు 2023 మధ్య సియెర్రా లియోన్‌లోని మూడు ప్రదేశాలలో పట్టుబడిన 846 అడవి చిన్న క్షీరదాలపై ఒక క్రమబద్ధమైన వైరమ్ విశ్లేషణను నిర్వహించారు. ఈ అధ్యయనం యొక్క లక్ష్యాలు: వైరస్ వైవిధ్యాన్ని గుర్తించడం, వివిధ జాతుల మధ్య వ్యాప్తి చెందే సామర్థ్యం ఉన్న వైరస్‌లను గుర్తించడం, జంతువుల నుండి మనుషులకు సంక్రమించే ప్రమాదాన్ని అంచనా వేయడం, మరియు కొత్తగా పుట్టుకొస్తున్న అంటువ్యాధుల కోసం ముందస్తు హెచ్చరిక వ్యవస్థలకు మద్దతు ఇచ్చే ఆధారాలను సృష్టించడం.

ప్రధాన పద్ధతులు

ఈ అధ్యయనం ఒక సమగ్ర వైరల్ మెటాజెనోమిక్స్ వర్క్‌ఫ్లోను అనుసరించింది:

• నమూనా ప్రాసెసింగ్:గుండె, కాలేయం, ప్లీహం, ఊపిరితిత్తులు మరియు మూత్రపిండాల కణజాలాలను సేకరించి, కలిపి, సజాతీయంగా చేసి, మొత్తం RNA సంగ్రహణకు గురిచేశారు.
• క్రమబద్ధీకరణ మరియు కూర్పు:లైబ్రరీ నిర్మాణానికి ముందు రైబోసోమల్ RNA తొలగింపు జరిగింది, ఆ తర్వాత ఇల్యూమినా నోవాసీక్ 6000 ప్లాట్‌ఫారమ్‌ను ఉపయోగించి హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ చేయబడింది. వైరల్ కాంటిగ్‌లు డీ నోవో పద్ధతిలో సమీకరించబడ్డాయి.
• వైరస్ గుర్తింపు:RNA-ఆధారిత RNA పాలిమరేస్ (RdRp) జన్యు అమరిక ఆధారంగా వైరస్‌లను గుర్తించారు. బాక్టీరియా, శిలీంధ్ర మరియు మొక్కల వైరస్‌లను మినహాయించి, వెన్నెముక గల జీవులతో సంబంధం ఉన్న వైరస్‌లను మాత్రమే పరిగణనలోకి తీసుకున్నారు.
• బయోఇన్ఫర్మాటిక్స్ విశ్లేషణ:ఫైలోజెనెటిక్ పునర్నిర్మాణం, పునఃసంయోగ విశ్లేషణ, జాతుల మధ్య వ్యాప్తి నెట్‌వర్క్ నమూనా, మరియు జూనోటిక్ ప్రమాద అంచనా వంటివి నిర్వహించబడ్డాయి.
• సీరలాజికల్ ధ్రువీకరణ:గబ్బిలం లెడంటేవైరస్ 2 కోసం VSV-ఆధారిత సూడోవైరస్ తటస్థీకరణ పరీక్షను అభివృద్ధి చేశారు. 2.8% మానవ సీరమ్‌లలో తటస్థీకరణ యాంటీబాడీలు కనుగొనబడ్డాయి, ఇది జంతువుల నుండి మానవులకు సంక్రమించే అవకాశం ఉందని రుజువు చేస్తుంది.
  

  అధ్యయనంఫలితాలు

  1. వైరల్ ఆవిష్కరణ మరియు వైవిధ్యం

  ఈ అధ్యయనం సియెర్రా లియోన్‌లో సేకరించిన ఎలుకలు, గబ్బిలాలు మరియు ష్రూలతో సహా 846 అడవి జంతువులపై ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ విశ్లేషణను నిర్వహించింది. పూర్తి RNA-ఆధారిత RNA పాలిమరేస్ (RdRp) జన్యు శ్రేణుల ఆధారంగా, మొత్తం 39 క్షీరద-సంబంధిత RNA వైరస్‌లను గుర్తించారు, వీటిలో ఇదివరకే తెలిసిన 13 వైరస్‌లు మరియు 26 కొత్త వైరస్‌లు ఉన్నాయి.

  వైరస్ కూర్పు పరంగా, పారామిక్సోవిరిడే కుటుంబం మూడు అతిధేయ క్రమాలలో అత్యధిక స్థాయి వైవిధ్యాన్ని ప్రదర్శించింది, దాని తర్వాత ఆస్ట్రోవిరిడే మరియు పికోర్నావిరిడే ఉన్నాయి. అతిధేయ పంపిణీకి సంబంధించి, ఎలుకలు అత్యధిక వైరస్ వైవిధ్యాన్ని అందించాయి, ఇవి మొత్తం 26 వైరస్ జాతులను కలిగి ఉన్నాయి, ఇది ఈ ప్రాంతంలో వైరస్ వైవిధ్యానికి నిల్వలుగా వాటి ప్రముఖ పాత్రను సూచిస్తుంది.

  2. జూనోటిక్ ప్రమాదం

  జంతువుల నుండి మానవులకు వ్యాపించే వ్యాధుల ప్రమాద అంచనాలో, ఎన్సెఫలోమయోకార్డిటిస్ వైరస్, లాసా వైరస్, మరియు రోకాహెపెవైరస్ జాతులు అనే మూడు తెలిసిన జూనోటిక్ వైరస్‌లను గుర్తించారు. అదనంగా, మెలియన్ వైరస్, రోడెంట్ హెపటైటిస్ వైరస్, మరియు హన్నివైరస్ A అనే ​​మూడు వైరస్‌లు వ్యాప్తి చెందే ప్రమాదం ఉన్నట్లుగా గుర్తించారు.

  కొత్తగా కనుగొనబడిన 26 వైరస్‌లలో, ఫైలోజెనెటిక్ మరియు జన్యు లక్షణాల ఆధారంగా నాలుగు వైరస్‌లు అధిక జూనోటిక్ సామర్థ్యాన్ని కలిగి ఉంటాయని అంచనా వేయబడింది. ముఖ్యంగా, బాట్ లెడంటేవైరస్ 2, మానవులకు సోకే లె డాంటెక్ వైరస్‌తో అత్యంత సన్నిహిత ఫైలోజెనెటిక్ సంబంధాన్ని ప్రదర్శించింది.

  తదనంతర సీరాలజికల్ పరిశోధన ఈ విషయాన్ని మరింత బలపరిచింది, ఎందుకంటే స్థానిక నివాసితుల సీరమ్‌లలో 2.8%లో బ్యాట్ లెడంటేవైరస్ 2కు వ్యతిరేకంగా తటస్థీకరణ యాంటీబాడీలు కనుగొనబడ్డాయి. ఈ ఫలితం మానవ జనాభాలో గుర్తించబడని లేదా లక్షణాలు లేని ఇన్ఫెక్షన్లు ఇప్పటికే సంభవించి ఉండవచ్చని సూచిస్తుంది, ఇది ఇంతకుముందు గుర్తించబడని ఒక సంభావ్య జూనోటిక్ ప్రసార మార్గాన్ని వెలుగులోకి తెస్తుంది.

  3. జాతుల మధ్య సంక్రమణ గతిశీలత

  వివిధ జాతుల మధ్య వ్యాప్తి విశ్లేషణలో, ఎలుకలు వైరస్ పంచుకునే నెట్‌వర్క్‌లో కేంద్ర స్థానాన్ని ఆక్రమించి, ఆతిథ్య జాతుల మధ్య వైరస్ మార్పిడిని సులభతరం చేసే కీలక కేంద్రాలుగా పనిచేస్తున్నాయని వెల్లడైంది. మొత్తం 15 వైరస్‌లు వివిధ జాతుల మధ్య వ్యాప్తి చెందే సామర్థ్యాన్ని కలిగి ఉన్నట్లు గుర్తించబడ్డాయి.

  వివిధ క్రమాల మధ్య వైరస్ వ్యాప్తి నమూనాలపై జరిపిన తదుపరి విశ్లేషణలో, ఒకే వర్గీకరణ క్రమంలోని ఆతిథేయుల మధ్య వైరస్ పంచుకోవడం ఎక్కువగా జరుగుతుందని తేలింది. ఇది, వైరస్ వ్యాప్తి గతిశీలతలో ఆతిథేయుల మధ్య బంధుత్వం ఒక ముఖ్యమైన పాత్ర పోషిస్తుందని సూచిస్తుంది. దీనికి విరుద్ధంగా, గబ్బిలాలు వివిధ క్రమాల మధ్య వైరస్ వ్యాప్తి చేసే సామర్థ్యాన్ని సాపేక్షంగా తక్కువగా ప్రదర్శించాయి.

  ముఖ్యంగా, కొన్ని వైరస్‌లలో ఆతిథేయ పరిధి విస్తరణకు సంబంధించిన ఆధారాలు గమనించబడ్డాయి. ఉదాహరణకు, గతంలో ష్రూలకు మాత్రమే ప్రత్యేకమైనదిగా భావించిన మెలియన్ వైరస్, ఈ అధ్యయనంలో రోడెంట్లలో కూడా కనుగొనబడింది. ఇది ఆతిథేయ అనుకూలతలో సంభావ్య మార్పును మరియు విస్తృత వ్యాప్తికి పెరిగిన ప్రమాదాన్ని సూచిస్తుంది.

  

  ముగింపులు మరియు ప్రజారోగ్య పరిణామాలు

  • అడవి చిన్న క్షీరదాలలో అధిక వైరస్ వైవిధ్యం:26 కొత్త జాతులతో సహా 39 RNA వైరస్‌ల ఆవిష్కరణ, ఈ ప్రాంతంలో ఒక పెద్ద వైరస్ నిల్వ ఉందని వెల్లడించడమే కాకుండా, అధిక జూనోటిక్ సామర్థ్యం గల కొత్త వైరస్‌లను (ఉదాహరణకు, బాట్ లెడంటేవైరస్ 2) మొదటిసారిగా నివేదిస్తుంది.
  • ప్రాధాన్యతా నిఘా లక్ష్యాలుగా ఎలుకలు:ఎలుకలు వైరస్ వ్యాప్తికి కీలక కేంద్రాలుగా పనిచేస్తాయి మరియు అత్యధిక వైరస్ వైవిధ్యాన్ని కలిగి ఉంటాయి, ఇవి అత్యధిక వ్యాప్తి ప్రమాదాన్ని సూచిస్తాయి.
  • సమీకృత నిఘా వ్యూహాల అవసరం:క్రియాశీల నిఘా కార్యక్రమాలలో ఎలుకలకు ప్రాధాన్యత ఇవ్వడాన్ని, అలాగే మానవ-వన్యప్రాణుల అనుసంధాన ప్రాంతాలలో మెటాజెనోమిక్స్, సీరాలజీ మరియు పర్యావరణ పర్యవేక్షణలను మిళితం చేసే సమీకృత విధానాలను అమలు చేయడాన్ని ఈ పరిశోధన ఫలితాలు సమర్థిస్తున్నాయి.

  మొత్తం మీద, ఈ అధ్యయనం కొత్తగా వ్యాపిస్తున్న జంతుజన్య వ్యాధుల కోసం ముందస్తు హెచ్చరిక వ్యవస్థలు మరియు ప్రమాద అంచనా చట్రాలకు మద్దతు ఇవ్వడానికి కీలకమైన సాక్ష్యాలను అందిస్తుంది, అలాగే అధిక ప్రమాదం ఉన్న ప్రాంతాలలో చురుకైన నిఘా యొక్క ప్రాముఖ్యతను బలపరుస్తుంది.

  ఉత్పత్తి సమాచారం